Biskup płocki prof. Stanisław Wielgus mianował nowe władze Wyższego Seminarium Duchownego w Płocku.
Rektorem Uczelni Ksiądz Biskup mianował ks. dr. Bogdana Czupryna, profesora filozofii w płockim Seminarium. Nowy rektor przyjął święcenia kapłańskie w 1982 r. W latach 1986-93 piastował funkcję prefekta studiów i prefekta ds. wychowawczych WSD. W 1993 r. na Wydziale Filozofii KUL-u obronił rozprawę doktorską nt. Swoistość procesów poznawczych jako podstawa transcendencji człowieka. W roku 2001 został mianowany kanonikiem honorowym Kapituły Katedralnej. Od 2004 r. jest asystentem kościelnym Katolickiego Stowarzyszenia Lekarzy w Płocku.
Wicerektorem WSD został mianowany ks. dr Remigiusz Stacherski. Kapłanem jest od 1995 r.
W 2003 r. obronił rozprawę doktorską nt. Tolerancja religijna jako cnota w życiu społecznym na Uniwersytecie Laterańskim. W tym samym roku został mianowany wicedyrektorem Niższego Seminarium Duchownego w Płocku z siedzibą w Sikorzu, podejmując jednocześnie wykłady z teologii moralnej w Wyższym Seminarium Duchownym. W czerwcu 2004 r. został mianowany prefektem ds. wychowawczych WSD.
Nominację na prefekta otrzymał ks. dr Mirosław Milewski. Święcenia kapłańskie przyjął 14 czerwca 1997 r. w Płocku. W latach 1998-2004 odbył w Katolickim Uniwersytecie Lubelskim studia specjalistyczne z zakresu socjologii i katolickiej nauki społecznej. W czerwcu 2004 r., na podstawie rozprawy Społeczne uwarunkowania postaw młodzieży wobec AIDS, uzyskał stopień doktora nauk humanistycznych z zakresu socjologii. Od 2004 r. jest pracownikiem Kurii Diecezjalnej Płockiej.
Prefektem WSD Biskup Płocki mianował także ks. dr. Tomasza Lewickiego. Święcenia kapłańskie przyjął on w 1996 r. W latach 1997-2003 odbył studia specjalistyczne w Fakultecie Teologicznym Paderborn, w zakresie egzegezy Nowego Testamentu, uwieńczone uzyskaniem stopnia doktora teologii. Od 2004 r. jest wykładowcą Pisma Świętego Nowego Testamentu w WSD w Płocku i w Punkcie Konsultacyjnym UKSW w Płocku.
Podziękowania Biskupa Płockiego dla dotychczasowych przełożonych oraz skład nowych władz seminaryjnych ogłosił kanclerz Kurii Diecezjalnej ks. prał. dr Kazimierz Ziółkowski podczas uroczystego zakończenia roku w Wyższym Seminarium Duchownym w sobotę 18 czerwca.
W podziękowaniu dla ks. prof. Ireneusza Mroczkowskiego Biskup Płocki napisał: „Z żalem, chociaż także ze zrozumieniem, przyjąłem decyzję Księdza Rektora o rezygnacji z trzeciej kadencji rektorskiej w Wyższym Seminarium Duchownym w Płocku.
Jestem pełen wielkiego uznania dla całej dotychczasowej, bezcennej dla Kościoła płockiego i dla rozwoju nauk teologicznych, pracy kapłańskiej i dydaktyczno-naukowej Księdza Rektora, ale szczególnie dla Jego pracy rektorskiej, pełnionej tak bardzo kompetentnie i z tak ogromnym zaangażowaniem, w ciągu minionych 6 lat.
Z całego serca dziękuję Księdzu Rektorowi za ogromny trud, który włożył w prowadzenie Seminarium; za wielki osobisty wkład w proces wszechstronnego rozwoju intelektów, charakterów, serc i sumień wychowywanych alumnów; za głębokie, mądre, wierne Bogu i podstawowym chrześcijańskim wartościom wystąpienia rektorskie; za wielki takt i osobistą kulturę w kontaktach z profesorami, klerykami i wszystkimi pracownikami; za niezawodną wierność i lojalność wobec Kościoła; za roztropną troskę o wszelkie dobro seminaryjne; za niezmiernie cenne przygotowywanie naszych studentów do życia i pracy we współczesnym, tak bardzo skomplikowanym świecie; za żywy, serdeczny kontakt z całym duchowieństwem diecezjalnym; a także za to, że dzięki swojemu wielkiemu autorytetowi moralnemu i kompetencjom naukowym, w sposób bardzo znaczący przyczynił się Ksiądz Rektor do zauważalnego przez wszystkich podniesienia prestiżu naszej Alma Mater wśród wielu innych polskich uczelni wyższych, duchownych i nie tylko duchownych.
Do słów szczerej wdzięczności dołączam najlepsze życzenia wielu naukowych, dydaktycznych i duszpasterskich osiągnięć na następnym etapie życia kapłańskiego i profesorskiego, a przede wszystkim Bożej Opieki i Bożego błogosławieństwa na każdy dzień”.
Słowa podziękowania Biskup Stanisław skierował także do ks. dr. Tadeusza Kozłowskiego. Napisał w nich: „W związku z zakończeniem długoletniej służby na stanowisku wicerektora Wyższego Seminarium Duchownego w Płocku pragnę wyrazić
Księdzu Profesorowi wielką wdzięczność za bardzo ofiarną, kompetentną, realizowaną z wielkim oddaniem i poczuciem odpowiedzialności pracę wychowawczą, dydaktyczną i organizacyjną. Z całego serca dziękuję za troskę, jaką Ksiądz Profesor okazywał wielu rocznikom alumnów, za całkowitą wierność Kościołowi diecezjalnemu, za dzielenie się z nami wszystkimi darem swojej żywej inteligencji i osobistej wielkiej kultury, za bezcenną umiejętność trafiania do najbardziej nawet zamkniętych osobowości, za dobroć i życzliwość, którą Ksiądz Doktor hojnie obdarzał wszystkich stykających się z Nim ludzi.
Na drogę nowych obowiązków i wyzwań, jakie niesie prawie każdy dzień, życzę najserdeczniej Księdzu Profesorowi Bożego błogosławieństwa i Bożej pomocy w przezwyciężaniu ciągle obecnych problemów i trosk”.
Dziękując ks. dr. Leszkowi Misiarczykowi, Biskup Płocki napisał: „Przychylając się ze zrozumieniem do prośby Księdza Doktora o zwolnienie, z 31 sierpnia 2005 r., z funkcji Prefekta ds. Studiów Wyższego Seminarium Duchownego w Płocku, pragnę jednocześnie bardzo serdecznie podziękować Księdzu za gorliwą, bardzo ważną dla wychowania i wykształcenia nowych pokoleń kapłańskich, pracę.
Ogromnie się cieszę z wielkiego zaangażowania Księdza Doktora w pracę dydaktyczno-naukową, przy ciągłej pamięci o darze, ważniejszym niż cokolwiek innego, Chrystusowego kapłaństwa. Z całego serca życzę Księdzu wielu znaczących osiągnięć w pracy badawczej i profesorskiej”.