Zbiory w głównej mierze stanowią pamiątki przekazane przez nieżyjącego ks. prof. Wilhelma Gaja-Piotrowskiego oraz przekazywane przez innych ofiarodawców związane ze świętym. – Lokalizacja muzeum przy stalowowolskim kościele Matki Bożej Królowej Polski jest nieprzypadkowa i nawiązuje do związków Jana Pawła II ze Stalową Wolą sięgające czasów, gdy jako arcybiskup krakowski poświęcił w 1973 r. kościół stalowowolski oraz do historii działań „Solidarności”, gdy w latach 80. XX wieku w obiektach parafialnych gromadzili się stalowowolscy opozycjoniści. Tam też koncentrowało się niezależne życie kulturalne. Nie można też pominąć roli Jana Pawła II jako inspiratora przemian w Polsce, znaczenie jego pielgrzymki do Polski w czerwcu 1979 r. w kontekście powstania zaledwie w rok później wielomilionowej „Solidarności” – powiedział ks. Stanisław Gurba, dyrektor stalowowolskiego muzeum.

Na ekspozycji zwiedzający mogą podziwiać eksponaty kolekcjonerskie: medale, monety, plakietki oraz pamiątki po papieżu Polaku. Numizmaty przypominają wydarzenia z życia św. Jana Pawła II, np.: medal pamiątkowy z VII wizyty Papieża Polaka w Ziemi Świętej w 2000 r., medal z wizerunkiem Jana Pawła II upamiętniający wybór Benedykta XVI na papieża, wizytę Jana Pawła II na Kubie w 1998 r., pielgrzymkę do Sandomierza w 1999 r., monetę okolicznościową o nominale 200 zł z 2002 r. W zbiorach muzeum znajduje się również ornat, w którym Jan Paweł II odprawiał Msze św. w Sandomierzu czy piuska papieska z podróży apostolskiej do Afryki. Wystawę uzupełniają liczne fotografie, listy, dokumenty papieskie oraz unikatowy, pełny komplet obrazków związanych ze świętami Bożego Narodzenia i Zmartwychwstania Pańskiego, wydawanych przez Topografia Poliglotta Vaticana przez 26 lat pontyfikatu św. Jana Pawła II.

Mimo nagromadzenia przedmiotów odnoszących się do różnych części świata muzeum chce pokazywać związki św. Jana Pawła II z regionem stalowowolskim. Jak mówi ks. Gurba: – Wystawa została tak zaaranżowana, by promowała region stalowowolski. Wielkoformatowe fotografie umieszczone w korytarzu prowadzącym do sal wystawowych pokazują związki papieża ze Stalową Wolą, rozpoczynające się od czasu, gdy jako kardynał krakowski poświęcił w 1973 r. nowo wybudowany stalowowolski kościół, wówczas pod wezwaniem Najświętszej Maryi Panny, dziś Matki Bożej Królowej Polski. Fotografie prezentują historię budowy świątyni, przerywanej przez antykościelne działania władz komunistycznych. Dopowiedzeniem wystawy fotografii jest kalendarium życia i działalności Karola Wojtyły. Muzeum jest w posiadaniu wielu eksponatów z pamiętnej wizyty Jana Pawła II na ziemi sandomierskiej, m.in. fotela z czarnego dębu wykonananego przez Jana Łyko z Rudnika n. Sanem, medalu z podobizną Jana Pawła II upamiętniającego flis Ulanów-Gdańsk w 1997 r., naczyń liturgicznych, bielizny ołtarzowej i wielu innych. Realizując zadania statutowe, muzeum posiada nie tylko ekspozycję stałą, ale organizowane są również wystawy czasowe o tematyce papieskiej i historycznej, promującej artystów i działalność kulturową przybliżającą pontyfikat św. Jana Pawła II i dzieje regionu.